Hola Tito!
En tu caso, deberías ir a un sitio especializado en calzado deportivo para que examinaran tu pisada (pisada en pronación o supinación) y comprar el calzado adecuando. Esto amortiguará en impacto de tu pie contra el suelo y por tanto la presión que se ejerce en la rodilla. Además cuando acabes deberías aplicar un poco de hielo (siempre protegientdote con un trapito) en la zona.

Un Saludo!